清帝退位时，他为陆军大臣，黯然返回老家乡居。袁世凯称帝前，请其出山，王氏保守消极，袁克定出马恭请，王又拒之。克定请其火车上相见谈事，说话间车轮已动，形同绑架，到京后获授陆军上将。袁世凯称帝期间，他称病休假。张勋复辟时，他开门迎之，扶持12岁之溥仪登位，这时他是参谋部尚书。段祺瑞马上誓师讨逆，复辟分子四散。王士珍继任陆军总长。
他的古文很有底子，文化程度在北洋高阶将领中，居上之上。其人也盲目尽忠清廷，毕生清朝蓝袍坎肩着装，脑后留蓄小辫子，和辜鸿铭、张勋竟是一伙，但他比他们懂得收敛，不像他们那样张扬外露。
他在任时，只穿长袍马褂，从不着军服，也不挂勋章。他的外表决不像职业军人，也不像学者，倒仿佛一个土头土脑的村学究。